Большое Протопопово — деревня в Томском районе, входит в Мирненское сельское поселение.
Население 371 человек.
Большое Протопопово расположено на левом берегу реки Ушайки, в 4 км от центра сельского поселения посёлка Мирный.
Добраться до деревни можно на автобусе № 210 (ОКБ — садоводческое общество «Весна» — Трубачёво — Мирный — Малое Протопопово — Большое Протопопово — Межениновка).
В период с 1920 по 1976 годы деревня была центром Протопоповского сельского Совета, в 1976 году центр сельсовета был перенесён в посёлок Мирный, впоследствии ставший центром Мирненского сельского поселения.
Микрорайоны: 1-й микрорайон Авиатор, 2-й микрорайон Авиатор, микрорайон Авиаторов. Улицы: Арбатская, Нагорная, Озёрная, Равенства, Советская.
К востоку от деревни находится Детский лагерь «Восход», ранее принадлежавший ЗАТО Северск. На склоне обрыва Ушайки строится православный храм.
