Воскресенская церковь является одним из самых интересных храмовых сооружений Томска. Церковь стоит на Воскресенской горе, которая получила свое название от первой деревянной церкви «Во имя Воскресения Христова», построенной здесь в 1622 году основателями Томска.
Деревянный храм находился восточнее нынешнего каменного, на территории Свято-Успенского мужского монастыря.
Вскоре, в 1626 году, монастырь был закрыт, и Воскресенская церковь стала приходской.
Двухэтажное каменное здание нынешнего храма возводили Егор Домоневский и Петр Баранов с 1789 по 1807 год на средства прихожан.
Нижний алтарь храма был освящен во имя Воскресения Господня 18 октября 1803 года. Через несколько дней деревянный Воскресенский храм был разобран и вывезен на берег реки Томи со всей утварью, где его полностью сожгли, а прах развеяли по ветру над рекой — таков был обычай.
Верхний предел был освящен 16 июня 1807 г. во имя Успения Пресвятой Богородицы
5 октября 1858 года в церкви состоялось венчание сосланного в Томск известного общественного деятеля, философа, теоретика анархизма Михаила Александровича Бакунина с томской дворянкой Антониной Ксаверьевной Квятковской. На церемонии присутствовал в качестве посаженого отца родственник Бакунина — генерал-губернатор Восточной Сибири граф Н..Муравьев-Амурский.
С 1892 года при церкви действовало попечительство о бедных. В 1896 году была открыта церковно-приходская школа. для мальчиков и девочек, здание для которой было построено на пожертвования купца Иннокентия Евграфовича Кухтерина. Содержалась школа на средства совета Томского женского Епархиального училища и Кухтерина. В 1897 году Кухтериным был куплен на Ирбитской ярмарке Большой крест для церкви.
Не раз помогал Воскресенской церкви А.А.Васильев, жертвуя большие суммы на нужды храма. За заслуги перед церковью Васильев был похоронен в ограде Воскресенской церкви, где до сих пор сохранилась его могила и надгробная мраморная плита. В 1906 г. в церкви венчалась участница Первой мировой войны, создательница женских батальонов смерти Мария Бочкарева.
Западнее храма, на краю обрыва, была сооружена колокольня для колокола, отлитого в 1896 году по инициативе и на средства томского купца Андрея Афанасьевича Васильева. Колокол был отлит в честь. коронации царя Николая II и царицы Александры Федоровны.
Томский «Царь-колокол» отливали на знаменитом колокольном заводе Оловянишникова в Ярославле и доставили в Томск в ноябре 1896 года по железной дороге и санным путем. Весил колокол около 17 тонн, стоил более чем 18 тысяч рублей и был третьим по величине в Сибири — после иркутского и тобольского. 21 декабря 1897 года над Томском впервые раздался звон Царь-колокола.
Двадцатые и тридцатые годы XX века стали трагическими для Воскресенской церкви. В 1922 году из церкви была изъята часть серебряной церковной утвари – большие и малый кресты, подсвечники, кадило, лампады. А в 19ЗО году колокол был сброшен, разбит и вместе с колоколами других Томских церквей отправлен на переплавку.
В 19З6 году храм был окончательно закрыт. В 1937 году была предпринята попытка разрушения церкви. Но снесена была лишь церковная ограда. В конце 30-х годов в помещении церкви находился гараж для машин, затем зерносклад, в 40-е годы — Центральный государственный архив РСФСР Дальнего Востока.
Новую жизнь Воскресенская церковь начала 16 августа 1995 года, когда вновь состоялось ее освящение. А копия знаменитого колокола была поднята на вновь выстроенную звонницу в 2004 году.
